Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PPLO60437 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPLO60437 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPLO60437 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPLO60437 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPLO60437 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPLO60437 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPLO60437 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPLO60437 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PPLO60437 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPLO60437 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPLO60437 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPLO60437 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPLO60437 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPLO60437 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPLO60437 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPLO60437 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PPLO60437 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPLO60437 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPLO60437 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPLO60437 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPLO60437 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPLO60437 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPLO60437 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPLO60437 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPLO60437 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PPLO60437 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPLO60437 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPLO60437 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPLO60437 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPLO60437 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPLO60437 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms