Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9YO00507 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9YO00507 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9YO00507 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9YO00507 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9YO00507 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9YO00507 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9YO00507 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9YO00507 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9YO00507 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9YO00507 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9YO00507 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9YO00507 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9YO00507 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9YO00507 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9YO00507 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9YO00507 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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USP9YO00507 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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USP9YO00507 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9YO00507 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9YO00507 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9YO00507 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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USP9YO00507 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9YO00507 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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USP9YO00507 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9YO00507 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9YO00507 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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USP9YO00507 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9YO00507 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9YO00507 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9YO00507 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9YO00507 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9YO00507 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9YO00507 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9YO00507 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9YO00507 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP9YO00507 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9YO00507 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9YO00507 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9YO00507 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9YO00507 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9YO00507 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9YO00507 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9YO00507 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9YO00507 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9YO00507 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9YO00507 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9YO00507 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9YO00507 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9YO00507 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9YO00507 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP9YO00507 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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