Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms