Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms