Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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