Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrp1b-212ENSMUST00000204204 798 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmd10-201ENSMUST00000033805 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Ifna13-201ENSMUST00000105149 819 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms