Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms