Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PcolceQ61398 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PcolceQ61398 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PcolceQ61398 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PcolceQ61398 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PcolceQ61398 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PcolceQ61398 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PcolceQ61398 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PcolceQ61398 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PcolceQ61398 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PcolceQ61398 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PcolceQ61398 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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PcolceQ61398 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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