Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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