Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms