Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA11P31270 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms