Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ubl3Q9Z2M6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms