Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Mrpl28Q9D1B9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Mrpl28Q9D1B9 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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