Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
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