Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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