Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms