Protein–RNA interactions for Protein: Q00973

B4GALNT1, Beta-1,4 N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT1Q00973 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4GALNT1Q00973 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms