Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK-24P63145 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms