Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms