Protein–RNA interactions for Protein: S4R1R7

Rpl9-ps1, MCG50795, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl9-ps1S4R1R7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpl9-ps1S4R1R7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl9-ps1S4R1R7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rpl9-ps1S4R1R7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rpl9-ps1S4R1R7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl9-ps1S4R1R7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl9-ps1S4R1R7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl9-ps1S4R1R7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms