Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn7Q9Z261 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn7Q9Z261 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn7Q9Z261 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn7Q9Z261 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn7Q9Z261 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn7Q9Z261 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn7Q9Z261 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cldn7Q9Z261 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn7Q9Z261 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cldn7Q9Z261 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn7Q9Z261 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn7Q9Z261 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn7Q9Z261 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn7Q9Z261 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms