Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ror1Q9Z139 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ror1Q9Z139 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ror1Q9Z139 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ror1Q9Z139 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ror1Q9Z139 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ror1Q9Z139 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ror1Q9Z139 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ror1Q9Z139 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ror1Q9Z139 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ror1Q9Z139 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ror1Q9Z139 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ror1Q9Z139 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ror1Q9Z139 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ror1Q9Z139 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ror1Q9Z139 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ror1Q9Z139 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms