Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Skp2Q9Z0Z3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Skp2Q9Z0Z3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms