Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vax2Q9WTP9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vax2Q9WTP9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vax2Q9WTP9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vax2Q9WTP9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vax2Q9WTP9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vax2Q9WTP9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vax2Q9WTP9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vax2Q9WTP9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vax2Q9WTP9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vax2Q9WTP9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vax2Q9WTP9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vax2Q9WTP9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vax2Q9WTP9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vax2Q9WTP9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vax2Q9WTP9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vax2Q9WTP9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms