Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubd1Q9R1K7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubd1Q9R1K7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tubd1Q9R1K7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubd1Q9R1K7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms