Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
CtsfQ9R013 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CtsfQ9R013 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.1 ms