Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tnnt3Q9QZ47 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tnnt3Q9QZ47 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tnnt3Q9QZ47 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tnnt3Q9QZ47 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tnnt3Q9QZ47 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Tnnt3Q9QZ47 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tnnt3Q9QZ47 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Tnnt3Q9QZ47 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Tnnt3Q9QZ47 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tnnt3Q9QZ47 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tnnt3Q9QZ47 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tnnt3Q9QZ47 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tnnt3Q9QZ47 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tnnt3Q9QZ47 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tnnt3Q9QZ47 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tnnt3Q9QZ47 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tnnt3Q9QZ47 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tnnt3Q9QZ47 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tnnt3Q9QZ47 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tnnt3Q9QZ47 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tnnt3Q9QZ47 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tnnt3Q9QZ47 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tnnt3Q9QZ47 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tnnt3Q9QZ47 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tnnt3Q9QZ47 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tnnt3Q9QZ47 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tnnt3Q9QZ47 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tnnt3Q9QZ47 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tnnt3Q9QZ47 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tnnt3Q9QZ47 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tnnt3Q9QZ47 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Tnnt3Q9QZ47 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tnnt3Q9QZ47 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tnnt3Q9QZ47 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tnnt3Q9QZ47 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tnnt3Q9QZ47 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tnnt3Q9QZ47 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tnnt3Q9QZ47 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tnnt3Q9QZ47 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tnnt3Q9QZ47 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tnnt3Q9QZ47 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tnnt3Q9QZ47 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tnnt3Q9QZ47 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tnnt3Q9QZ47 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tnnt3Q9QZ47 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tnnt3Q9QZ47 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tnnt3Q9QZ47 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tnnt3Q9QZ47 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tnnt3Q9QZ47 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tnnt3Q9QZ47 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tnnt3Q9QZ47 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tnnt3Q9QZ47 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tnnt3Q9QZ47 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tnnt3Q9QZ47 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tnnt3Q9QZ47 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tnnt3Q9QZ47 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tnnt3Q9QZ47 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tnnt3Q9QZ47 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tnnt3Q9QZ47 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tnnt3Q9QZ47 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tnnt3Q9QZ47 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tnnt3Q9QZ47 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tnnt3Q9QZ47 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms