Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul3Q9JLV5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms