Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Aldh9a1Q9JLJ2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Aldh9a1Q9JLJ2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Aldh9a1Q9JLJ2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Aldh9a1Q9JLJ2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Aldh9a1Q9JLJ2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Aldh9a1Q9JLJ2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms