Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr5Q9JLF7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr5Q9JLF7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tlr5Q9JLF7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlr5Q9JLF7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlr5Q9JLF7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlr5Q9JLF7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr5Q9JLF7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr5Q9JLF7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr5Q9JLF7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr5Q9JLF7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr5Q9JLF7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlr5Q9JLF7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlr5Q9JLF7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlr5Q9JLF7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tlr5Q9JLF7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms