Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ybx3Q9JKB3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ybx3Q9JKB3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ybx3Q9JKB3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ybx3Q9JKB3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Ybx3Q9JKB3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ybx3Q9JKB3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ybx3Q9JKB3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ybx3Q9JKB3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ybx3Q9JKB3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ybx3Q9JKB3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ybx3Q9JKB3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ybx3Q9JKB3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ybx3Q9JKB3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ybx3Q9JKB3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ybx3Q9JKB3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ybx3Q9JKB3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ybx3Q9JKB3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ybx3Q9JKB3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ybx3Q9JKB3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ybx3Q9JKB3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Ybx3Q9JKB3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ybx3Q9JKB3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ybx3Q9JKB3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ybx3Q9JKB3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ybx3Q9JKB3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ybx3Q9JKB3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ybx3Q9JKB3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ybx3Q9JKB3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ybx3Q9JKB3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ybx3Q9JKB3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Ybx3Q9JKB3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Ybx3Q9JKB3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ybx3Q9JKB3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ybx3Q9JKB3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ybx3Q9JKB3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Ybx3Q9JKB3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ybx3Q9JKB3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ybx3Q9JKB3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ybx3Q9JKB3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ybx3Q9JKB3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ybx3Q9JKB3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ybx3Q9JKB3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ybx3Q9JKB3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ybx3Q9JKB3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ybx3Q9JKB3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ybx3Q9JKB3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Ybx3Q9JKB3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ybx3Q9JKB3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ybx3Q9JKB3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ybx3Q9JKB3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ybx3Q9JKB3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ybx3Q9JKB3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ybx3Q9JKB3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ybx3Q9JKB3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ybx3Q9JKB3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ybx3Q9JKB3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ybx3Q9JKB3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ybx3Q9JKB3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ybx3Q9JKB3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ybx3Q9JKB3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ybx3Q9JKB3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ybx3Q9JKB3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Ybx3Q9JKB3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ybx3Q9JKB3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ybx3Q9JKB3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ybx3Q9JKB3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms