Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtf2ird1Q9JI57 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms