Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pus3Q9JI38 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pus3Q9JI38 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pus3Q9JI38 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pus3Q9JI38 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pus3Q9JI38 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pus3Q9JI38 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pus3Q9JI38 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pus3Q9JI38 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pus3Q9JI38 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pus3Q9JI38 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pus3Q9JI38 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pus3Q9JI38 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pus3Q9JI38 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pus3Q9JI38 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pus3Q9JI38 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pus3Q9JI38 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pus3Q9JI38 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pus3Q9JI38 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pus3Q9JI38 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pus3Q9JI38 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pus3Q9JI38 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pus3Q9JI38 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pus3Q9JI38 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pus3Q9JI38 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pus3Q9JI38 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pus3Q9JI38 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pus3Q9JI38 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Pus3Q9JI38 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pus3Q9JI38 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pus3Q9JI38 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pus3Q9JI38 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pus3Q9JI38 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pus3Q9JI38 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pus3Q9JI38 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pus3Q9JI38 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pus3Q9JI38 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pus3Q9JI38 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pus3Q9JI38 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pus3Q9JI38 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Pus3Q9JI38 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pus3Q9JI38 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pus3Q9JI38 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Pus3Q9JI38 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pus3Q9JI38 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pus3Q9JI38 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pus3Q9JI38 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pus3Q9JI38 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pus3Q9JI38 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pus3Q9JI38 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pus3Q9JI38 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pus3Q9JI38 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pus3Q9JI38 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pus3Q9JI38 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pus3Q9JI38 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pus3Q9JI38 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pus3Q9JI38 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms