Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms