Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ropn1Q9ESG2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ropn1Q9ESG2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ropn1Q9ESG2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ropn1Q9ESG2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ropn1Q9ESG2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ropn1Q9ESG2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ropn1Q9ESG2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ropn1Q9ESG2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ropn1Q9ESG2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ropn1Q9ESG2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ropn1Q9ESG2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ropn1Q9ESG2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ropn1Q9ESG2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ropn1Q9ESG2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ropn1Q9ESG2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ropn1Q9ESG2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ropn1Q9ESG2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ropn1Q9ESG2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ropn1Q9ESG2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ropn1Q9ESG2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms