Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb3Q9ERD7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb3Q9ERD7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb3Q9ERD7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb3Q9ERD7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb3Q9ERD7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb3Q9ERD7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb3Q9ERD7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb3Q9ERD7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb3Q9ERD7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb3Q9ERD7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tubb3Q9ERD7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb3Q9ERD7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb3Q9ERD7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb3Q9ERD7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb3Q9ERD7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb3Q9ERD7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb3Q9ERD7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb3Q9ERD7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tubb3Q9ERD7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb3Q9ERD7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb3Q9ERD7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb3Q9ERD7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb3Q9ERD7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb3Q9ERD7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb3Q9ERD7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb3Q9ERD7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb3Q9ERD7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms