Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap29Q9ERB0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap29Q9ERB0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms