Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Clstn1Q9EPL2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clstn1Q9EPL2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clstn1Q9EPL2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clstn1Q9EPL2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clstn1Q9EPL2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clstn1Q9EPL2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clstn1Q9EPL2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clstn1Q9EPL2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clstn1Q9EPL2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clstn1Q9EPL2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clstn1Q9EPL2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clstn1Q9EPL2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clstn1Q9EPL2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clstn1Q9EPL2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms