Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

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Length 606 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tm9sf1Q9DBU0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tm9sf1Q9DBU0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tm9sf1Q9DBU0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tm9sf1Q9DBU0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tm9sf1Q9DBU0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tm9sf1Q9DBU0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tm9sf1Q9DBU0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tm9sf1Q9DBU0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tm9sf1Q9DBU0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tm9sf1Q9DBU0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tm9sf1Q9DBU0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tm9sf1Q9DBU0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tm9sf1Q9DBU0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tm9sf1Q9DBU0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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