Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBN9

Ddx59, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX59, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx59Q9DBN9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx59Q9DBN9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx59Q9DBN9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx59Q9DBN9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx59Q9DBN9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddx59Q9DBN9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddx59Q9DBN9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddx59Q9DBN9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddx59Q9DBN9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddx59Q9DBN9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddx59Q9DBN9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddx59Q9DBN9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddx59Q9DBN9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddx59Q9DBN9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddx59Q9DBN9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddx59Q9DBN9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddx59Q9DBN9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddx59Q9DBN9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddx59Q9DBN9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddx59Q9DBN9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ddx59Q9DBN9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ddx59Q9DBN9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx59Q9DBN9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms