Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pdzd9Q9D9M4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pdzd9Q9D9M4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Pdzd9Q9D9M4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pdzd9Q9D9M4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pdzd9Q9D9M4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pdzd9Q9D9M4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pdzd9Q9D9M4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pdzd9Q9D9M4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pdzd9Q9D9M4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pdzd9Q9D9M4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pdzd9Q9D9M4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pdzd9Q9D9M4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pdzd9Q9D9M4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pdzd9Q9D9M4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pdzd9Q9D9M4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pdzd9Q9D9M4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pdzd9Q9D9M4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pdzd9Q9D9M4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pdzd9Q9D9M4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pdzd9Q9D9M4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pdzd9Q9D9M4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pdzd9Q9D9M4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pdzd9Q9D9M4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pdzd9Q9D9M4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pdzd9Q9D9M4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pdzd9Q9D9M4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pdzd9Q9D9M4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pdzd9Q9D9M4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pdzd9Q9D9M4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pdzd9Q9D9M4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pdzd9Q9D9M4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pdzd9Q9D9M4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Pdzd9Q9D9M4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pdzd9Q9D9M4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pdzd9Q9D9M4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Pdzd9Q9D9M4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Pdzd9Q9D9M4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pdzd9Q9D9M4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pdzd9Q9D9M4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pdzd9Q9D9M4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pdzd9Q9D9M4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pdzd9Q9D9M4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pdzd9Q9D9M4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pdzd9Q9D9M4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pdzd9Q9D9M4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pdzd9Q9D9M4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pdzd9Q9D9M4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pdzd9Q9D9M4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pdzd9Q9D9M4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Pdzd9Q9D9M4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pdzd9Q9D9M4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pdzd9Q9D9M4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pdzd9Q9D9M4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Pdzd9Q9D9M4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pdzd9Q9D9M4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pdzd9Q9D9M4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pdzd9Q9D9M4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pdzd9Q9D9M4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pdzd9Q9D9M4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pdzd9Q9D9M4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pdzd9Q9D9M4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pdzd9Q9D9M4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pdzd9Q9D9M4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pdzd9Q9D9M4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pdzd9Q9D9M4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pdzd9Q9D9M4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pdzd9Q9D9M4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pdzd9Q9D9M4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pdzd9Q9D9M4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pdzd9Q9D9M4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pdzd9Q9D9M4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pdzd9Q9D9M4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Pdzd9Q9D9M4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pdzd9Q9D9M4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pdzd9Q9D9M4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Pdzd9Q9D9M4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Pdzd9Q9D9M4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pdzd9Q9D9M4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Pdzd9Q9D9M4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pdzd9Q9D9M4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pdzd9Q9D9M4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pdzd9Q9D9M4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Pdzd9Q9D9M4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pdzd9Q9D9M4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pdzd9Q9D9M4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pdzd9Q9D9M4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Pdzd9Q9D9M4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pdzd9Q9D9M4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pdzd9Q9D9M4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms