Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chmp5Q9D7S9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chmp5Q9D7S9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chmp5Q9D7S9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chmp5Q9D7S9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chmp5Q9D7S9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chmp5Q9D7S9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chmp5Q9D7S9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chmp5Q9D7S9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chmp5Q9D7S9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Chmp5Q9D7S9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chmp5Q9D7S9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chmp5Q9D7S9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chmp5Q9D7S9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chmp5Q9D7S9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chmp5Q9D7S9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chmp5Q9D7S9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chmp5Q9D7S9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chmp5Q9D7S9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chmp5Q9D7S9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chmp5Q9D7S9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Chmp5Q9D7S9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chmp5Q9D7S9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Chmp5Q9D7S9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chmp5Q9D7S9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chmp5Q9D7S9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chmp5Q9D7S9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chmp5Q9D7S9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chmp5Q9D7S9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chmp5Q9D7S9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chmp5Q9D7S9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chmp5Q9D7S9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chmp5Q9D7S9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chmp5Q9D7S9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chmp5Q9D7S9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chmp5Q9D7S9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chmp5Q9D7S9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chmp5Q9D7S9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chmp5Q9D7S9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chmp5Q9D7S9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chmp5Q9D7S9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chmp5Q9D7S9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chmp5Q9D7S9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chmp5Q9D7S9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chmp5Q9D7S9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chmp5Q9D7S9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chmp5Q9D7S9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chmp5Q9D7S9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chmp5Q9D7S9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chmp5Q9D7S9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chmp5Q9D7S9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Chmp5Q9D7S9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Chmp5Q9D7S9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms