Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6B9

Hrct1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hrct1Q9D6B9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hrct1Q9D6B9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hrct1Q9D6B9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hrct1Q9D6B9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hrct1Q9D6B9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hrct1Q9D6B9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hrct1Q9D6B9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hrct1Q9D6B9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hrct1Q9D6B9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hrct1Q9D6B9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hrct1Q9D6B9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hrct1Q9D6B9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hrct1Q9D6B9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hrct1Q9D6B9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hrct1Q9D6B9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hrct1Q9D6B9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hrct1Q9D6B9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hrct1Q9D6B9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hrct1Q9D6B9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hrct1Q9D6B9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hrct1Q9D6B9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hrct1Q9D6B9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hrct1Q9D6B9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hrct1Q9D6B9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hrct1Q9D6B9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hrct1Q9D6B9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Hrct1Q9D6B9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hrct1Q9D6B9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hrct1Q9D6B9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hrct1Q9D6B9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hrct1Q9D6B9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.02■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hrct1Q9D6B9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hrct1Q9D6B9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hrct1Q9D6B9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hrct1Q9D6B9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hrct1Q9D6B9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hrct1Q9D6B9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hrct1Q9D6B9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hrct1Q9D6B9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hrct1Q9D6B9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hrct1Q9D6B9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hrct1Q9D6B9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hrct1Q9D6B9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hrct1Q9D6B9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hrct1Q9D6B9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hrct1Q9D6B9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hrct1Q9D6B9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hrct1Q9D6B9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hrct1Q9D6B9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hrct1Q9D6B9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hrct1Q9D6B9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hrct1Q9D6B9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hrct1Q9D6B9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hrct1Q9D6B9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hrct1Q9D6B9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hrct1Q9D6B9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hrct1Q9D6B9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hrct1Q9D6B9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hrct1Q9D6B9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hrct1Q9D6B9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hrct1Q9D6B9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hrct1Q9D6B9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hrct1Q9D6B9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms