Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt34Q9D646 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt34Q9D646 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt34Q9D646 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt34Q9D646 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt34Q9D646 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt34Q9D646 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt34Q9D646 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt34Q9D646 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt34Q9D646 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt34Q9D646 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt34Q9D646 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt34Q9D646 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt34Q9D646 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt34Q9D646 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt34Q9D646 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt34Q9D646 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt34Q9D646 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt34Q9D646 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt34Q9D646 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt34Q9D646 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt34Q9D646 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt34Q9D646 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt34Q9D646 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt34Q9D646 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt34Q9D646 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt34Q9D646 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt34Q9D646 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms