Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V5

Cul5, Cullin-5, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul5Q9D5V5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cul5Q9D5V5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul5Q9D5V5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul5Q9D5V5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cul5Q9D5V5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cul5Q9D5V5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul5Q9D5V5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul5Q9D5V5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul5Q9D5V5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul5Q9D5V5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul5Q9D5V5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul5Q9D5V5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul5Q9D5V5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul5Q9D5V5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul5Q9D5V5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cul5Q9D5V5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cul5Q9D5V5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cul5Q9D5V5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cul5Q9D5V5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cul5Q9D5V5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cul5Q9D5V5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cul5Q9D5V5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cul5Q9D5V5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cul5Q9D5V5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cul5Q9D5V5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cul5Q9D5V5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cul5Q9D5V5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cul5Q9D5V5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cul5Q9D5V5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cul5Q9D5V5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cul5Q9D5V5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cul5Q9D5V5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cul5Q9D5V5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cul5Q9D5V5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cul5Q9D5V5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cul5Q9D5V5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cul5Q9D5V5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cul5Q9D5V5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cul5Q9D5V5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cul5Q9D5V5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cul5Q9D5V5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul5Q9D5V5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul5Q9D5V5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul5Q9D5V5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul5Q9D5V5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul5Q9D5V5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul5Q9D5V5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul5Q9D5V5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul5Q9D5V5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul5Q9D5V5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul5Q9D5V5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul5Q9D5V5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul5Q9D5V5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul5Q9D5V5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul5Q9D5V5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul5Q9D5V5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul5Q9D5V5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul5Q9D5V5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul5Q9D5V5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul5Q9D5V5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms