Protein–RNA interactions for Protein: Q9D519

4930524N10Rik, RIKEN cDNA 4930524N10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524N10RikQ9D519 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930524N10RikQ9D519 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930524N10RikQ9D519 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930524N10RikQ9D519 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930524N10RikQ9D519 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
4930524N10RikQ9D519 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930524N10RikQ9D519 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930524N10RikQ9D519 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
4930524N10RikQ9D519 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4930524N10RikQ9D519 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.5 ms