Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2T6

1700034E13Rik, RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700034E13RikQ9D2T6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
1700034E13RikQ9D2T6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms