Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mrpl28Q9D1B9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms