Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms