Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx47Q9CWX9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx47Q9CWX9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx47Q9CWX9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx47Q9CWX9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx47Q9CWX9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx47Q9CWX9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx47Q9CWX9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx47Q9CWX9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx47Q9CWX9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx47Q9CWX9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx47Q9CWX9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx47Q9CWX9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx47Q9CWX9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx47Q9CWX9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx47Q9CWX9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx47Q9CWX9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx47Q9CWX9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx47Q9CWX9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx47Q9CWX9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx47Q9CWX9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx47Q9CWX9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx47Q9CWX9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx47Q9CWX9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx47Q9CWX9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx47Q9CWX9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx47Q9CWX9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx47Q9CWX9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx47Q9CWX9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx47Q9CWX9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx47Q9CWX9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx47Q9CWX9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx47Q9CWX9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx47Q9CWX9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx47Q9CWX9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ddx47Q9CWX9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx47Q9CWX9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx47Q9CWX9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx47Q9CWX9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx47Q9CWX9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx47Q9CWX9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx47Q9CWX9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx47Q9CWX9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx47Q9CWX9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx47Q9CWX9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx47Q9CWX9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx47Q9CWX9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx47Q9CWX9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx47Q9CWX9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx47Q9CWX9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx47Q9CWX9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx47Q9CWX9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx47Q9CWX9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx47Q9CWX9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx47Q9CWX9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx47Q9CWX9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx47Q9CWX9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx47Q9CWX9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx47Q9CWX9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx47Q9CWX9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Ddx47Q9CWX9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx47Q9CWX9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx47Q9CWX9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx47Q9CWX9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx47Q9CWX9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Ddx47Q9CWX9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx47Q9CWX9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx47Q9CWX9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx47Q9CWX9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx47Q9CWX9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx47Q9CWX9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx47Q9CWX9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx47Q9CWX9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx47Q9CWX9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx47Q9CWX9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx47Q9CWX9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx47Q9CWX9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx47Q9CWX9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx47Q9CWX9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx47Q9CWX9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx47Q9CWX9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx47Q9CWX9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx47Q9CWX9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx47Q9CWX9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx47Q9CWX9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx47Q9CWX9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx47Q9CWX9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx47Q9CWX9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx47Q9CWX9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx47Q9CWX9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx47Q9CWX9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx47Q9CWX9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx47Q9CWX9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx47Q9CWX9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms